Le origini di Patagonia si devono attribuire a Yvon Chouinard, un affermato arrampicatore, iniziò a vendere attrezzatura da arrampicata fatta a mano nel 1957 attraverso la sua azienda, chiamata Chouinard Equipment. Chouinard lavorò da solo finché nel 1965 divenne socio di Tom Frost così da migliorare la qualità dei suoi prodotti e affrontare la crescente domanda richiesta. Great Pacific Iron Works, il primo negozio di Patagonia, ha aperto nel 1973 a Santa Clara St. a Ventura. Patagonia ha ampliato la sua linea di prodotti includendo abbigliamento mirato ad altri sport, come il surf. Oltre all'abbigliamento, offrono altri prodotti come attrezzature sportive, zaini, sacchi a pelo e attrzzatura da campeggio. Patagonia ha anche una politica riguardante la merce in buone condizioni, ogni capo Patagonia può essere restituito per nuovi crediti merce. La merce usata viene pulita, riparata e rivenduta "Worn Wear". Nel 2019, ha lanciato un programma chiamato ReCrafted che crea e vende abiti realizzati con ritagli di tessuto provenienti da attrezzi Patagonia usati.