Die Ursprünge Patagoniens gehen auf Yvon Chouinard zurück, einen versierten Kletterer, der 1957 begann, handgefertigte Kletterausrüstung über seine Firma namens Chouinard Equipment zu verkaufen. Chouinard arbeitete allein, bis er 1965 Partner von Tom Frost wurde, um die Qualität seiner Produkte zu verbessern und der wachsenden Nachfrage gerecht zu werden. Great Pacific Iron Works, Patagoniens erstes Geschäft, wurde 1973 in der Santa Clara St. in Ventura eröffnet. Patagonia hat seine Produktlinie um Bekleidung für andere Sportarten wie Surfen erweitert. Neben Kleidung bieten sie weitere Produkte wie Sportgeräte, Rucksäcke, Schlafsäcke und Campingausrüstung an. Patagonia hat auch eine Richtlinie für Waren in gutem Zustand, jedes Patagonia-Kleidungsstück kann für neue Warengutschriften zurückgegeben werden. Die gebrauchte Ware wird gereinigt, repariert und „Used Wear“ weiterverkauft. 2019 startete er ein Programm namens ReCrafted, das Kleidung aus Stoffresten von gebrauchter Patagonia-Ausrüstung herstellt und verkauft.